該校始建于明朝正德年間，迄今已有五百年的歷史。十一屆三中全以來，運中這塊古老的學府圣地，又煥發出了新的生機。81年被確定為山西省首批重點中學，先后被收入《中國名校》、《中國教育大詞典》和《中國著名中學》等書，兩次被評為山西勞模集體。高考成績連年上升，95年達線327人，96年達線488人，97年達線528人，98年驟然增至626人，連續四年雄居全省之冠，英語實驗班的高考達線率高達98%，考入清華、北大、復旦、南開等名牌大學的學生人數也在全省名列前茅、被譽為“大學生的搖籃”，在古老的河東大地掀起了一股洶涌澎湃的“運中潮”。

運城，古稱河東，襟鹽湖而帶黃河，通三晉而達豫陜。河東故地，是華夏古老文化的發祥地之一，是名副其實的人文之鄉。

運城中學的前身為創建于明朝正德9年的河東書院，幾百年間幾經搬遷，時斷時續。新中國成立后，在黨和人民的關懷和支持下，運城中學再次恢復建校，郭沫若先生親筆為運城中學題寫了校名。