原天津市第四十三中學始建于1954年，1958年改制為完中校，1978年被定為區屬重點校，1990年被市教育局確定為首批高中校。1995年晉升為區屬市級重點中學。2007年7月，經天津市政府和國家教育部調整，原南開大學附屬中學整建制合并入原天津市第四十三中學并更名為南開大學附屬中學。

新校址坐落于天津市南開區三潭路，校園內寧靜幽雅的校園，是學校良好的育人環境；南開學子蓬勃的朝氣、立志成才的志向和惜時如金的求學精神，是學生最好的榜樣；濃郁的學術氣氛，是對學生的最好熏陶。附中在南開大學獨特的人文地理環境中形成了自己的辦學特色，四十五年培養了大批優秀人才，在社會上享有很高的聲譽。南開大學附屬中學和始建于清末的天津市南開中學是兩所不同的中學。

（新）南開大學附屬中學位于天津市南開區三潭路165號，毗鄰南開大學、天津大學。占地面積8萬多平方米，總建筑面積6.4萬平方米，有 10 座主體建筑，現有75個教學班，3400余名學生。