嘉興市第三中學建校于1928年，前身系意大利天主教會創辦的“明德女子中學”， 1951年7月，更名為私立明德初級中學，開始“擴充名額，男女兼收”。1952年被命名為“嘉興三中”，校址在中山路134號（現為旭輝廣場）。2002年8月，學校搬遷到環城南路611號（現為嘉興實驗初級中學教育集團），并于2004年開始初高中分離；三中初中和原洪波中學初中組建成“嘉興初級實驗中學”，三中高中部成為“嘉興市第三中學”。2009年8月，嘉興市第三中學搬遷至嘉興市雙溪路1922號高中園區內，占地155畝。

學校自創辦以來，培養學生三萬余人，校友遍布世界各地，各行各業，他們中有：美國耶魯大學終身教授、遺傳學家許田，知名商人、加拿大女皇金禧勛章獲得者詹建龍，北京法國電信研發中心的首席執行官王海拉，中國十大服裝設計師祁剛，書畫家凌加春，全運會雙冠王趙婧等。

在八十多年時代風雨變遷中，學校求生存、求發展、求創新，創造了一次次的輝煌。1980年學校被定為嘉興縣重點中學，2004年秋被評為浙江省三級重點高中，2007年春順利晉升為浙江省二級重點高中。2011年4月，正式掛牌嘉興教育學院實驗中學。2012年1月，被評為浙江省文明單位。此外，學校還是浙江省體育特色學校，浙江省新課程樣本學校。

學校有一支高素質的教師隊伍，教職員工141人，專任教師128人，其中中學高級教師51人，中級教師58人。嘉興市名校長培養人選1名，嘉興市名教師2名，嘉興市級學科帶頭人3名，嘉興市屬級學科帶頭人6人。學校現有36個教學班，學生1737名。

學校緊緊圍繞“明德?健康”的培養目標，以“明志厚德”為基，“發展青年身心，培育優良秉性”，培養學生“明德的高尚品格，健康的身體素質，健康的心理狀態，健康的智能活動，健康的審美感受，健康的生活情趣”，致力實現“滿足學生有個性地健康發展”的辦學理念。在浙江省深化課程改革的廣闊背景下，學校構建了特色鮮明的“必修課+明德五健選修課”的課程結構，實現“明德五健，健康發展” 的育人模式轉變，學校開設了近100門選修課程，滿足學生多樣化、個性化選擇學習的需要，為學生的科學成材創造了多元發展的平臺。學校積極推進現代學校制度改革，教育內涵不斷豐富，教育管理不斷科學，教學質量穩步提升。厚重的文化歷史承載著現代教育的文明，先進的育人理念演繹著莘莘學子的精彩，“高質量、有特色的百年名校”是嘉興三中不懈的追求。