廣東仲元中學始創于1934年春，是為紀念孫中山先生的得力助手、著名民主革命家鄧仲元先生而命名的一所紀念中學。辛亥革命元老胡漢民是首任董事長，著名政治家劉蘆隱為第一任校長。后因胡漢民逝世，董事會改組，蔣介石為名譽董事長，余漢謀為常務董事長。校址設在廣州文德路廣雅書局內（今廣州中山圖書館附近）。
1937年抗日戰爭爆發后，學校先后遷往廣州北郊蚌湖、韶關曲江鶴沖崗、粵東興寧羅浮司鄉、越秀山仲元圖書館辦學。期間發生梁鏡堯校長率仲元中學師生70余人與進犯日軍展開血戰，七英烈衛國捐軀事件，這英勇壯舉令中外震驚，名垂千古。1942年正式命名為“廣東省立仲元中學”。1946年8月，廣東仲元中學遷至番禺市橋鎮西郊大沙地繼續辦學至今?！拔母铩逼陂g學校曾易名“市橋一中”、“番禺縣第一中學”。1980年1月又復名為“廣東省立仲元中學”。

廣東仲元中學擁有優良的革命傳統和深厚的文化底蘊。解放后，一直是省、市、區的重點中學。1994年6月被首批評定為“廣東省一級學校”，2006年4月首批通過廣東省國家級示范性高中初期督導驗收。是廣東省新課程省、市級樣本學校。學?，F址占地70050平方米，建筑面積61280平方米。學校師資力量雄厚，高級教師和具有研究生學歷的教師共88人，占專任教師的45%。 廣東仲元中學擁有與辦學規模相適應的校園和校舍，實驗室、現代信息教育中心、藝術中心、體育中心、圖書館、探究性實驗室、標準400米田徑運動場、1000兆計算機互聯網絡等配套辦學設施一應俱全。為適應現代化教育的需要，實現了計算機等“多機一幕”進課室，教師普遍使用計算機、多媒體組織教育教學活動。