廈門市第三中學創辦于1924年，至今已有90年的歷史，學校前身可以追溯到廈門頗有名氣的禾山甲種商業學校、禾山書院和安睦書院。1953年1月6日，廈門市人民政府正式授名為廈門市第三中學。廈門三中是一所具有光榮的革命傳統的英雄學校，飲譽全國的“英雄小八路”群體就在這里成長，“中國少年先鋒隊隊歌”——《我們是共產主義接班人》從這里唱響。1962年2月，郭沫若先生為學校題寫校名。

學校地處廈門火炬高科技開發區旁，占地面積68789.8 m2。校園布局協調，功能區劃合理，擁有綜合辦公大樓、教學樓、實驗樓、師生宿舍樓、400米標準塑膠跑道的田徑運動場、圖書樓、多功能綜合體育館、生物園、地理園。學校現有59個教學班，學生3048人；教職工222人，專任教師202人，其中省、市級學科帶頭人和骨干教師26人，取得研究生或碩士學歷的教師20人。

辦學90年以來，學校全面貫徹黨的教育方針，依法治校，秉承“明德齊賢”的校訓和“辦學生樂學、教師樂業、社會樂道的學校”的辦學理念，以人為本，民主管理，倡導“敬業、博愛、務本、創新”的教風，培育“誠信、堅毅、和諧、進取”的校風和“勵志、勤學、慎思、篤行”的學風。不斷深化教育教學改革，大膽探索和實踐科技特色教育，扎實推進素質教育和課程改革，教育教學質量逐年穩步提高，高考、會考、中考成績喜人，機器人競賽、射擊、棋類、球類、田徑、武術、征文、演講等在全國、省、市級比賽中多次獲獎。近年來，學校先后榮獲“聯合國教科文組織中國可持續發展教育（EPD）項目示范學校”、“全國中小學思想道德建設活動先進單位”、“全國中小學心理健康教育優秀成果評選先進學校”、“國家語言文字規范化工作先進單位”、“全國全民健身活動先進單位”、“福建省實施素質教育工作先進學校”、“福建省推行辦事公開制度示范單位”、“福建省第四屆綠色學校”、“福建省教師普法教育活動優秀組織獎”、“福建省科技教育基地學校”、“廈門市禁毒教育示范學校”、“廈門市無吸煙學校”、“廈門市三項主題教育活動先進單位”、“廈門市平安校園”、“湖里區平安校園”、“湖里區創先爭優先進基層黨組織”、“湖里區學習型領導班子”、“湖里區學習型黨組織創建活動先進單位”、“湖里區首屆和諧校園示范校”等榮譽稱號，近三屆連續獲評“福建省文明學校”。